Notre équipe a développé une plateforme logicielle complète pour le traitement et l’analyse des IRM de cerveaux de rongeurs. Nos méthodes sont automatisées et ne nécessitent aucune mesure ou correction manuelle.

En bref, toutes les IRM anatomiques natives sont normalisées spatialement dans un espace de coordonnées anatomiques normalisé. Les images individuelles prétraitées sont enregistrées linéairement et non linéairement sur un modèle anatomique. Un atlas avec des structures neuroanatomiques prédéfinies est ensuite appliqué, permettant des mesures volumétriques régionales. Nous appliquons également un masque cortical, qui est utilisé pour l’analyse de l’épaisseur, comme décrit à la page suivante.