Nous sommes l’un des rares groupes au monde à pouvoir effectuer une analyse de l’épaisseur corticale sur des IRM de cerveaux de rongeurs. Nous avons développé un pipeline entièrement automatisé pour le calcul de mesures d’épaisseur corticale basées sur les sommets et les régions d’intérêt (ROI).

Ce schéma donne une vue d’ensemble de notre pipeline de traitement propriétaire. 

En utilisant le manteau cortical comme masque (A), une équation laplacien est utilisée pour identifier la ligne médiane (B) et étendre les lignes de courant de ce point aux surfaces interne et externe (C). La longueur de la ligne de courant à chaque sommet (D) de la surface génère une mesure de l’épaisseur corticale. Les longueurs de la ligne de courant peuvent ensuite être moyennées sur une région corticale spécifique, en utilisant un atlas de surface (E)  pour générer des données d’épaisseur moyenne régionale (F).

Étant donné que les images de toutes les souris se trouvent dans le même espace de coordonnées, il est également possible de moyenner les surfaces individuelles pour générer des cartes d’épaisseur moyenne de surface (G) pour chaque groupe de souris, qui peuvent ensuite être utilisées pour générer des comparaisons statistiques de surface entière, par groupe, telles que des cartes statistiques t (H).