Exemples de microglie segmentée. Le contour rouge indique le corps cellulaire et le contour jaune indique les ramifications.
Ce graphique montre, pour chaque cellule, dans quelle mesure la valeur de chaque paramètre, tel que le périmètre du soma de la cellule, influence la décision de classer les cellules comme activées ou non.
Les valeurs de Shapley (SHAP) indiquées sur le graphique représentent les effets additifs des différentes caractéristiques et peuvent être utilisées pour expliquer la décision de classification pour chaque cellule particulière. Chaque point représente la valeur du paramètre d’une cellule (indiquée par la couleur, où le rouge correspond à des valeurs supérieures à la moyenne) et son effet sur la décision, où des valeurs SHAP plus élevées tendent à classer les cellules comme activées.
Par exemple, les cellules avec un périmètre et une aire de soma élevés, une circularité de soma faible et un nombre élevé de branches dans leur squelette sont plus susceptibles d’être classées comme activées.
Notre modèle d’apprentissage automatique utilise des caractéristiques morphologiques pour distinguer la microglie non activée de la microglie activée. Le modèle prend des décisions explicables qui sont cohérentes avec la littérature. À titre d’exemple, les cellules avec un périmètre et une surface de soma plus élevés, un nombre plus élevé de branches et de points de ramification et une circularité de soma plus faible sont plus susceptibles d’être classées comme activées.