Les plaques sont segmentées en appliquant un flou gaussien au signal amyloïde et en utilisant un seuil d’hystérésis local pour approximer l’étendue de chaque plaque. La segmentation est ensuite affinée à l’aide d’opérations morphologiques visant à supprimer les petits trous dans les plaques identifiées et à rejeter les plus petites plaques.

Les plaques segmentées sont utilisées comme points de départ pour identifier les régions d’intérêt (ROI) concentriques en forme d’anneau avec une distance radiale croissante du noyau des plaques.

Pour générer les retours sur investissement, chaque plaque est d’abord élargie par dilatation binaire avec un élément structurant du disque de 5 μm. Nous soustrayons ensuite la segmentation initiale de la plaque de la plaque dilatée pour obtenir un retour sur investissement en forme d’anneau qui contient tous les pixels qui se trouvent à moins de 5 μm d’une plaque donnée. Ce processus est répété plusieurs fois pour générer des retours radiaux autour de toutes les plaques. Ces ROI radiaux sont utilisés ultérieurement pour localiser avec précision la neuroinflammation autour des plaques et pour quantifier la microgliose et l’astrogliose en fonction de la distance à la pathologie β-amyloïde.